MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p52

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017721	GAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615176
2	NC_017721	TGAAC	2	10	243	252	40 %	20 %	20 %	20 %	387615176
3	NC_017721	ATTG	2	8	384	391	25 %	50 %	25 %	0 %	387615176
4	NC_017721	ATA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615177
5	NC_017721	GAGG	2	8	810	817	25 %	0 %	75 %	0 %	387615177
6	NC_017721	GA	3	6	887	892	50 %	0 %	50 %	0 %	387615177
7	NC_017721	ACG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
8	NC_017721	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
9	NC_017721	AGC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
10	NC_017721	A	6	6	1131	1136	100 %	0 %	0 %	0 %	387615177
11	NC_017721	A	6	6	1185	1190	100 %	0 %	0 %	0 %	387615177
12	NC_017721	TCT	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615177
13	NC_017721	ACA	3	9	1345	1353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
14	NC_017721	AG	3	6	1360	1365	50 %	0 %	50 %	0 %	387615178
15	NC_017721	TGC	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615178
16	NC_017721	A	8	8	1430	1437	100 %	0 %	0 %	0 %	387615178
17	NC_017721	AAG	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615178
18	NC_017721	TG	3	6	1481	1486	0 %	50 %	50 %	0 %	387615178
19	NC_017721	ATC	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
20	NC_017721	GAT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
21	NC_017721	AGA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615178
22	NC_017721	TGG	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615178
23	NC_017721	TAG	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
24	NC_017721	GTAT	2	8	1640	1647	25 %	50 %	25 %	0 %	387615178
25	NC_017721	C	7	7	1649	1655	0 %	0 %	0 %	100 %	387615178
26	NC_017721	GAT	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
27	NC_017721	CAAA	2	8	1674	1681	75 %	0 %	0 %	25 %	387615178
28	NC_017721	GGC	2	6	1705	1710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615178
29	NC_017721	GCA	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615178
30	NC_017721	CTA	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
31	NC_017721	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	387615178
32	NC_017721	A	9	9	1755	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	387615178
33	NC_017721	GGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615178
34	NC_017721	CAT	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
35	NC_017721	ACA	3	9	1895	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
36	NC_017721	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
37	NC_017721	A	6	6	1926	1931	100 %	0 %	0 %	0 %	387615178
38	NC_017721	CGG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615178
39	NC_017721	TCAT	2	8	1967	1974	25 %	50 %	0 %	25 %	387615178
40	NC_017721	CT	3	6	2038	2043	0 %	50 %	0 %	50 %	387615178
41	NC_017721	T	6	6	2153	2158	0 %	100 %	0 %	0 %	387615178
42	NC_017721	CTGA	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	387615178
43	NC_017721	CGCT	2	8	2778	2785	0 %	25 %	25 %	50 %	387615179
44	NC_017721	TGC	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
45	NC_017721	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
46	NC_017721	TTC	2	6	3116	3121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
47	NC_017721	TTC	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
48	NC_017721	CCGC	2	8	3155	3162	0 %	0 %	25 %	75 %	387615179
49	NC_017721	TCCT	2	8	3255	3262	0 %	50 %	0 %	50 %	387615179
50	NC_017721	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
51	NC_017721	ATC	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615179
52	NC_017721	TCG	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
53	NC_017721	CT	4	8	3439	3446	0 %	50 %	0 %	50 %	387615179
54	NC_017721	TTC	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
55	NC_017721	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615179
56	NC_017721	GTTTC	2	10	3680	3689	0 %	60 %	20 %	20 %	387615179
57	NC_017721	AG	4	8	3702	3709	50 %	0 %	50 %	0 %	387615179
58	NC_017721	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615179
59	NC_017721	GTA	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615179
60	NC_017721	CCAC	2	8	3896	3903	25 %	0 %	0 %	75 %	387615179
61	NC_017721	TCC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615179
62	NC_017721	CGG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615179
63	NC_017721	TTC	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
64	NC_017721	CTT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
65	NC_017721	CAG	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615179
66	NC_017721	CCA	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615179
67	NC_017721	ATC	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615179
68	NC_017721	GAC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615180
69	NC_017721	CT	4	8	4225	4232	0 %	50 %	0 %	50 %	387615180
70	NC_017721	CCA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615180
71	NC_017721	CAGC	2	8	4332	4339	25 %	0 %	25 %	50 %	387615180
72	NC_017721	CGG	2	6	4351	4356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615180
73	NC_017721	CTCA	2	8	4393	4400	25 %	25 %	0 %	50 %	387615180
74	NC_017721	CGC	2	6	4409	4414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615180
75	NC_017721	GTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615180
76	NC_017721	TCA	3	9	4466	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615180
77	NC_017721	TC	3	6	4495	4500	0 %	50 %	0 %	50 %	387615180
78	NC_017721	A	6	6	4572	4577	100 %	0 %	0 %	0 %	387615181
79	NC_017721	GCT	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615181
80	NC_017721	CGA	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615181

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.